Theo Trung tâm Dự báo Khí tượng Thủy văn quốc gia, do ảnh hưởng của bão số 3, từ đêm 6/9 đến đêm 7/9, ở khu vực phía Đông Bắc Bộ và Thanh Hóa có mưa to đến rất to với lượng mưa phổ biến 100-300mm, cục bộ có nơi trên 400mm.

Ngày và đêm 7/9, khu vực phía Tây Bắc Bộ có mưa to đến rất to với lượng mưa phổ biến 70-150mm, cục bộ có nơi trên 200mm.
 
Khu vực Đông Bắc Bộ và Thanh Hoá: Từ đêm 6/9 đến đêm 7/9 có mưa 100-300mm; cục bộ có nơi trên 400mm; Phía Tây Bắc Bộ: Ngày và đêm 7/9 có mưa với lượng 70-150mm, cục bộ có nơi trên 200mm.

Ngoài ra, ngày 6/9, khu vực phía Đông Bắc Bộ và từ Thanh Hóa đến Thừa Thiên Huế có mưa rào và dông, cục bộ có nơi mưa to với lượng mưa từ 15-30mm, cục bộ có nơi trên 70mm; ngày và đêm 06/9, ở khu vực Tây Nguyên và Nam Bộ có mưa, mưa vừa và dông, cục bộ có nơi mưa to đến rất to với lượng mưa từ 20-40mm, cục bộ có nơi trên 80mm (mưa tập trung vào thời gian chiều và tối).

Trong mưa dông có khả năng xảy ra lốc, sét và gió giật mạnh.

Ngày và đêm 8/9, ở Bắc Bộ và Thanh Hóa có mưa vừa, có nơi mưa to và dông với lượng mưa phổ biến 20-60mm, cục bộ có nơi trên 90mm. Riêng khu vực Tây Bắc và Việt Bắc của Bắc Bộ có mưa to, có nơi mưa rất to với lượng mưa phổ biến 50-150mm, có nơi trên 250mm.

Mưa lớn và mưa lớn cục bộ có khả năng gây ra tình trạng ngập úng tại các vùng trũng, thấp; lũ quét trên các sông, suối nhỏ, sạt lở đất trên sườn dốc.

Ở Phú Quý đã có gió mạnh cấp 6, giật cấp 8; vùng biển phía Tây của khu vực Nam Biển Đông (bao gồm vùng biển phía Tây quần đảo Trường Sa) có gió mạnh cấp 6, có lúc cấp 7, giật cấp 8-9.

Vùng biển phía Tây của khu vực Bắc Biển Đông (bao gồm vùng biển quần đảo Hoàng Sa) có mưa bão; vịnh Bắc Bộ, vùng biển phía Tây của khu vực Bắc Biển Đông, khu vực Giữa Biển Đông, vùng biển từ Bình Thuận đến Cà Mau có mưa rào và dông.

Ngoài ra, ngày và đêm 6/9, khu vực Bắc Biển Đông (bao gồm vùng biển quần đảo Hoàng Sa), khu vực vịnh Bắc Bộ, khu vực Giữa Biển Đông, vùng biển phía Bắc khu vực Nam Biển Đông (bao gồm cả vùng biển quần đảo Trường Sa), vùng biển Quảng Trị đến Cà Mau, Cà Mau đến Kiên Giang và vịnh Thái Lan có mưa rào và dông; riêng vùng biển phía Tây Bắc của Bắc Biển Đông và Bắc Vịnh Bắc Bộ có mưa bão. Trong mưa dông có khả năng xảy ra lốc xoáy và gió giật mạnh.

Ngày và đêm 7/9: Vịnh Bắc Bộ (bao gồm huyện đảo Bạch Long Vỹ, Cô Tô): gió mạnh cấp 8-11, vùng gần tâm bão đi qua cấp 12-14, giật cấp 17; biển động dữ dội; sóng biển cao 3,0-5,0m, vùng gần tâm bão 6,0-8,0m.

Khu vực Bắc Biển Đông (bao gồm vùng biển quần đảo Hoàng Sa) gió Nam đến Đông Nam mạnh cấp 6-7, giật cấp 8-9, biển động mạnh; sóng biển cao 4,0-6,0m.

Vùng biển từ Quảng Trị đến Khánh Hòa có gió Tây Nam đến Nam mạnh cấp 6, giật cấp 7-8; biển động; sóng biển cao từ 3,0-5,0m. Đêm gió giảm dần.

Khu vực Giữa và Nam Biển Đông (bao gồm cả vùng biển quần đảo Trường Sa), vùng biển từ Ninh Thuận đến Cà Mau có gió Tây Nam mạnh cấp 6, có lúc cấp 7, giật cấp 8-9; biển động mạnh; sóng biển cao từ 3,0-6,0m. Đêm gió giảm dần.

Cấp độ rủi ro thiên tai do gió mạnh trên biển: cấp 3, vùng biển phía Tây Bắc của khu vực Bắc Biển Đông và phía Đông của khu vực Bắc vịnh Bắc Bộ cấp 4. 

Toàn bộ tàu thuyền hoạt động trên các khu vực trên đều có nguy cơ cao chịu tác động của lốc xoáy, gió mạnh và sóng lớn.